真核轉錄組測序技術

真核轉錄組測序技術是針對真核生物特定組織或細胞在某個特定時期轉錄出來的所有RNA進行測序。既可研究已知基因，亦能發掘新基因，全面快速地獲得mRNA序列和豐度信息。可以分為：有參考轉錄組和無參考轉錄組測序。

真核轉錄組測序技術數據解讀分析內容

1. 有參轉錄組標準信息分析
   • 對原始數據進行去除接頭、污染序列及低質量reads的處理
   • 測序評估：比對統計、測序隨機性評估、比對上序列在染色體的分布、比對上序列在基因區域的分布、比對結果可視化
   • 基因表達注釋：基因表達量、表達量分布、樣品聚類
   • 基因差異表達分析
   • 差異基因表達模式聚類分析
   • 差異表達基因GO功能顯著性富集分析：GO子類統計、GO富集分析、富集GO q值分布
   • 差異表達基因Pathway顯著性富集分析：KO富集分析、富集KO q值分布、通路結果注釋
   • 基因的可變剪接分析：可變剪接鑒定、統計、表達量分析
   • 預測新轉錄本：新轉錄本注釋、表達量統計、差異分析
   • SNP分析
   • 蛋白質互作網絡分析
2. 無參轉錄組標準信息分析
   • 對原始數據進行去除接頭、污染序列及低質量reads的處理
   • 數據產出統計及測序數據的堿基含量和質量評估
   • 組裝結果分析：組裝結果統計及轉錄本長度分布
   • 組裝結果評估：
     • 比對率分析、均一性分析
     • 組裝準確性評估、組裝結果注釋比例評估、Reads利用率及嵌合體比例評估、核心蛋白比率評估。
   • 預測編碼蛋白框（CDS）
   • Unigene功能注釋
   • Unigene的COG分類
   • Unigene的GO分類
   • Unigene代謝通路分析
   • Unigene表達量分析：Unigene的表達量估計及其分布統計，實驗樣品的聚類
   • Unigene表達差異分析
   • 差異表達的Unigene結果統計：數目統計、聚類分析、組間差異表達的Unigene分布統計
   • 差異表達的Unigene GO分類和Pathway富集性分析
   • 差異表達的Unigene功能注釋
   • SNP分析
   • SSR分析與引物設計。

樣本要求

1. 樣品類型：完整且無污染的總RNA；
2. 樣品需求量（單次）：200 ng； 2ug（真菌）
3. 樣品濃度：≥20ng/μL；≥40ng/μL（真菌）
4. 樣品純度：28S:18S≥1.0；RIN≥7.0（動物）；RIN≥6.5（植物&真菌）；昆蟲樣品無28S:18S及RIN值要求
5. 樣品OD值： 260/280≥1；260/230≥1.8；昆蟲和動物樣品無OD值要求