染色質免疫共沉淀技術

染色質免疫共沉淀技術（Chromatin Immunoprecipition, ChIP）研究蛋白質與DNA相互作用的經典方法。結合高通量測序ChIP-Seq可以在全基因組范圍內對蛋白結合位點進行高效而準確地篩選與鑒定，廣泛應用于組蛋白修飾，轉錄因子調控等相關領域的研究。

染色質免疫共沉淀技術，轉錄因子、DNA結合蛋白、組蛋白的不同修飾可以通過與染色質的相互作用直接影響染色質的構型、構象及相關基因的表達。

數據解讀分析內容：

1. 數據產出、過濾和質控
   • 下機數據過濾和質控圖表，去污染、接頭
2. 數據比對、tag分布信息
   • 比對結果
   • tags在各個區域內的分布
   • tag分布可視化
3. 組蛋白修飾特征
   • Peak基本數據統計
   • Peak在各個原件的分布情況
4. 差異組蛋白修飾區域
   • 差異組蛋白修飾區域的鑒定和注釋
5. 差異組蛋白修飾基因
   • 差異組蛋白修飾基因功能和通路分析

樣本要求：

1. 樣品類型： ChIP富集的DNA（客戶完成）
2. 樣品需求量：≥10 ng的ChIPed DNA
3.  樣品濃度：≥1 ng/µl
4. 樣品體積：≥20 μl
5. 樣品純度：OD260/280=1.8~2.0
6. 基因片段大小：分布在100~500 bp范圍，且主帶明顯，提供DNA打斷后的檢測膠圖