調(diào)控區(qū)域靶向捕獲甲基化測(cè)序技術(shù)

調(diào)控區(qū)域靶向捕獲甲基化測(cè)序技術(shù)（LHC-Seq）是通過(guò)設(shè)計(jì)相應(yīng)的探針序列，特異性捕獲感興趣的基因片段，捕獲序列進(jìn)一步通過(guò)重亞硫酸鹽處理，高通量測(cè)序分析目標(biāo)區(qū)域的甲基化水平。該技術(shù)是大樣本量，固定區(qū)域甲基化檢測(cè)的優(yōu)選，可廣泛應(yīng)用于臨床樣本甲基化特異性區(qū)域的鑒定以及與疾病相關(guān)的甲基化Bio-Marker的篩選和驗(yàn)證。

調(diào)控區(qū)域靶向捕獲甲基化測(cè)序技術(shù)可服務(wù)的范圍如下：

1. 常規(guī)芯片捕獲服務(wù)包括自主研發(fā)的全基因組啟動(dòng)子及關(guān)鍵調(diào)控區(qū)域的芯片（promoter capture-BS）、全外顯子芯片（exome-BS）及NimbleGen的SeqCap Epi芯片等
2. 個(gè)性化探針設(shè)計(jì)，可根據(jù)不同需要協(xié)助完成靶區(qū)域的探針合成及相關(guān)服務(wù)
3. 提供單樣本雜交和多樣本混合后pooling雜交的服務(wù)策略，可*地降低實(shí)驗(yàn)成本。

4. 數(shù)據(jù)解讀分析內(nèi)容

5. 數(shù)據(jù)產(chǎn)出、過(guò)濾和質(zhì)控
   • 下機(jī)數(shù)據(jù)過(guò)濾和質(zhì)控圖表，去污染、接頭
   • 統(tǒng)計(jì)reads長(zhǎng)度，reads數(shù)據(jù)，數(shù)據(jù)產(chǎn)量
6. 數(shù)據(jù)比對(duì)、甲基化信息
   • 比對(duì)結(jié)果、Bisulfite轉(zhuǎn)化率統(tǒng)計(jì)，捕獲效率統(tǒng)計(jì)
   • 目標(biāo)區(qū)域內(nèi)覆蓋度以及覆蓋深度統(tǒng)計(jì)
   • 目標(biāo)區(qū)域內(nèi)甲基化修飾位點(diǎn)及水平結(jié)果
7. 甲基化修飾特征
   • 目標(biāo)區(qū)域甲基化修飾水平的特征及統(tǒng)計(jì)
8. 差異甲基化修飾區(qū)域
   • 差異甲基化修飾區(qū)域(DMR)的鑒定和注釋
9. 差異甲基化修飾基因
   • 差異甲基化修飾基因功能和通路分析。

10. 樣本要求

11. 樣品類型：無(wú)降解，無(wú)污染的DNA樣品；
12. 樣品需求量：?jiǎn)蝹€(gè)樣本雜交的起始量大于3μg；多樣本混合雜交，每個(gè)樣本的基因組DNA量大于1.5μg。
13. 樣品濃度：≥30 ng/μl;
14. 樣品純度：OD260/280=1.8~2.0，不含蛋白和RNA等污染