詳細介紹
精確DNA甲基化測序技術可應用于高通量測序平臺(如全基因組甲基化測序oxWGBS、簡化的甲基化測序oxRRBS等常規測序技術);Infinium 450 K芯片檢測平臺;焦磷酸測序和靶基因檢測等不同平臺。對于全面研究胚胎發育、衰老機制、疾病發生發展的表觀遺傳機制和篩選疾病相關的甲基化標記位點具有重要的意義。
精確DNA甲基化測序技術
數據解讀分析內容
- 基本數據處理
- 原始數據評估,去除接頭與過濾低質量數據;
- reads數量以及數據產出統計。
- 基礎生物學信息分析
- 將測序數據與參考基因組比對,統計比對結果;
- 基于比對結果,統計各C位點的甲基化修飾信息;
- 測序數據的堿基覆蓋深度及覆蓋度統計;
- 胞嘧啶(CG、CHG、CHH)甲基化水平統計;
- 基因組甲基化分布及修飾特征分析;
- 高級生物學信息分析
- 結合項目背景的差異甲基化修飾位點(DMS)的鑒定、注釋和分布分析;
- 結合項目背景的差異甲基化修飾區域(DMR)的鑒定、注釋和分布分析;
- 結合項目背景的差異甲基化修飾基因的功能、通路和疾病等富集分析;
- 結合項目背景,與其他多組學數據的關聯分析。
樣本要求
- 樣品類型:無降解,無污染的DNA樣品;
- 樣品需求量:≥3μg;單個樣品構建2個不同的文庫;
- 樣品濃度:≥30 ng/μl;
- 樣品純度:OD260/280=1.8~2.0
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